申请人面临的主要风险包括恶意索赔、保函期限无限顺延、保证金长期冻结、项目延期被迫持续追加保函；受益人风险集中在保函格式不规范、有效期不足、担保银行资质不足、关键索赔条款缺失。针对上述风险，需要建立标准化审核机制。文本层面杜绝开放式无期限保函，谨慎接受自动无限延期条款；明确担保金额递减机制，预付款保函随履约进度逐步下调保额。受益人应当核实开立保函机构的正规资质，拒绝无法核验真伪的非正式保函。申请人尽量在基础合同中约定恶意索赔对应的违约责任，保留完整施工、供货、验收凭证作为维权证据。资金规划上，预留保函延期、赔付预案。同时区分主合同变更与保函效力，甲乙双方修改合同工期、价款等关键内容后，务必同步通知银行，视情况变更保函，防止出现保函与合同内容脱节，引发索赔争议。